با اعلام باشگاه سپاهان، حسین حسینی با قراردادی به مدت دو فصل به این تیم پیوست. حسینی سابقه حضور در تیم‌های استقلال، ملوان و برق شیراز را دارد. کاپیتان پیشین استقلال در فصل گذشته لیگ نخبگان آسیا، بیشترین سیو موفق را در بین دروازه‌بان‌های حاضر در این رقابت‌ها داشته است.
اختلافات بین حسین حسینی و هواداران استقلال از میانه‌های فصل گذشته شروع شد و با وجود عملکرد خوب او درون دروازه استقلال، نتوانست محبوبیت و مقبولیت قبل را حفظ کند.
امروز هم علی تاجرنیا، رئیس هیئت مدیره استقلال در گفتگو با تلویزیون اینترنتی استقلال درباره وضعیت حسین حسینی گفت: «ساپینتو به ما گفت که من حتماً یک گلر خارجی برای دروازه‌بان اول می‌خواهم و حسینی را به‌عنوان دروازه‌بان دوم می‌خواهم و یک دروازه‌بان امید هم برای گلر سوم جذب کنید. طبیعتا این کار را سخت خواهد کرد. کاپیتان تیم، دروازه‌بان تیم ملی روی نیمکت بنشیند. به نظر ما شان او رعایت نخواهد شد.»
