روزنامه بریتانیایی فایننشال تایمز در گزارشی درباره حملات سایبری جمهوری اسلامی به اسرائیل نوشت این حملات همچنان بعد از جنگ ۱۲ روزه ادامه دارد. بر اساس این گزارش، در روزهای پس از حمله اسرائیل، مقامات اسرائیلی انبوهی از پیامک‌های مشکوک حاوی لینک‌های مخرب دریافت کردند.
روزنامه تلگراف گزارش داد پس از آنکه اسرائیل حدود ۳۰ تن از عوامل برنامه هسته‌ای حکومت ایران را از پا درآورد، جمهوری اسلامی متخصصان باقی‌مانده خود را به «مخفی‌گاه‌های امن» فرستاده است.
رسانه‌های لبنان از انفجار در یکی از تاسیسات حزب‌الله در صور در جنوب این کشور خبر دادند و اضافه کردند که پیش از ۱۰ آمبولانس به محل انفجار در تاسیسات حزب‌الله رسیدند و نیروهای ارتش نیز در محل حضور دارند.
مسعود پزشکیان، رییس دولت چهاردهم، در صداوسیمای جمهوری اسلامی حضور یافت و در سخنانی با اشاره به جنگ ۱۲ روزه، گفت اسرائیل با «هدایت و حمایت» آمریکا و در راستای اهداف واشینگتن، به‌دنبال ترور فرماندهان و دانشمندان جمهوری اسلامی و در نهایت ایجاد هرج و مرج بود.
با بازسازی زرادخانه موشکی جمهوری اسلامی و توسعه پدافند پیشرفته اسرائیل، دو طرف درگیر رقابتی راهبردی شده‌اند که شکل و بهای جنگ بعدی را تعیین خواهد کرد. به گفته یهوشوعا کالی‌سکی از مؤسسه مطالعات امنیت ملی، جنگ‌های آینده با [حکومت] ایران باید کوتاه و متمرکز باشد.
بیش از ۴۰ روز پس از جنگ ۱۲ روزه ایران و اسرائیل و در حالی که ده‌ها فرمانده ارشد سپاه پاسداران کشته شدند و هنوز جانشینان برخی از پست‌های کلیدی معرفی نشده‌اند، خلأ فرماندهی سپاه پرسش‌های تازه‌ای درباره ثبات و انسجام ساختار نظامی جمهوری اسلامی ایجاد کرده است.
دو خبرنگار اسرائیلی، یوسی ملمن و دن راویو، فاش کردند که موساد چگونه طی سال‌ها با جذب نیرو از مخالفان جمهوری اسلامی کماندوهایی برای عملیات در خاک ایران آماده کرده است. براساس این گزاش، این نیروها، نقشی کلیدی در جنگ ۱۲ روزه میان اسرائیل و جمهوری اسلامی داشتند.
در حالی که مقام‌های جمهوری اسلامی در مقاطع زمانی مختلف اعلام کرده‌اند که ایران مجروحان جنگ غزه و اعضای حزب‌الله لبنان را در کشور درمان کرده، محمدرضا ظفرقندی، وزیر بهداشت دولت پزشکیان، درمان مجروحان جنگ غزه در ایران را تکذیب کرده است.
دونالد ترامپ، رییس‌جمهوری ایالات متحده، اعلام کرد با توجه به اینکه زرادخانه هسته‌ای در حال ساخت جمهوری اسلامی به‌طور کامل نابود شده، از کشورهای خاورمیانه می‌خواهد به توافقات صلح ابراهیم با اسرائیل بپیوندند.
در پی حملات هوایی ایالات متحده به سه مرکز هسته‌ای ایران در اول تیرماه به دستور دونالد ترامپ، منابع امنیتی به روزنامه دیلی‌میل هشدار داده‌اند که جمهوری اسلامی ممکن است به کمک نیروهای نیابتی خود، از جمله حزب‌الله و حماس، حملاتی تلافی‌جویانه را از درون خاک آمریکا تدارک دیده باشد.
جمهوری‌اسلامی و اسرائیل، هر دو خود را برای جنگ بعدی آماده می‌کنند.
مرکز رسانه قوه قضاییه از اعدام روزبه وادی، به اتهام «جاسوسی و همکاری اطلاعاتی» به نفع اسرائیل خبر داد. کانال خبرنامه دانشگاه امیرکبیر ساعاتی پس از انتشار خبر اعدام وادی، نوشت که او از اعضای پژوهشگاه علوم و فنون هسته‌ای وابسته به سازمان انرژی اتمی ایران بوده است.
دونالد ترامپ، رییس‌جمهوری آمریکا، با اشاره به اقدامات خود برای خاتمه دادن به جنگ‌ها در جهان به جنگ ۱۲ روزه اسرائیل و جمهوری اسلامی اشاره کرد و گفت اگر آمریکا به تاسیسات هسته‌ای ایران حمله نمی‌کرد، «آن‌ها ظرف دو ماه به سلاح هسته‌ای دست پیدا می‌کردند.»
محمد بهرامی، عضو کمیسیون انرژی مجلس شورای اسلامی، آتش‌سوزی‌های اخیر در صنایع نفت، گاز و پتروشیمی را «غیرعادی» خواند و بخشی از آن‌ها را به حملات اسرائیل نسبت داد.
یدالله جوانی، معاون سیاسی سپاه پاسداران، در پاسخ به انتقادها درباره اینکه چرا چین و روسیه در جریان جنگ ۱۲ روزه به ایران کمک نکردند، گفت چون تهران از آن‌ها کمک نخواست و از طرفی، قراردادهای طولانی‌مدت با این دو کشور شامل الزام آن‌ها به دفاع از جمهوری اسلامی در جریان جنگ نمی‌شود.
عباس عراقچی، وزیر امور خارجه جمهوری اسلامی، اعلام کرد از سرنوشت و محل نگهداری فعلی ذخایر اورانیوم ۶۰ درصدی حکومت ایران اطلاعی ندارد، اما این ذخایر پیش‌تر در تاسیساتی نگهداری می‌شد که هدف بمباران آمریکا قرار گرفتند. عراقچی همچنین از سرگیری جنگ با اسرائیل را محتمل دانست.
روزنامه نیویورک‌تایمز به نقل از گروه‌های حقوق بشری گزارش داد دست‌کم چهار شهروند دوتابعیتی ایرانی-آمریکایی در ایران بازداشت شده‌اند که از این میان، دو نفر پس از جنگ ۱۲ روزه و دو تن دیگر سال ۲۰۲۴ میلادی دستگیر شدند.
دیوید لمی، وزیر خارجه بریتانیا، گفت توجیه جمهوری اسلامی درباره ضرورت غنی‌سازی ۶۰ درصدی اورانیوم برای فعالیت‌های تحقیقاتی را نمی‌پذیرد. او همچنین تاکید کرد هرگونه تصمیمی برای سرنگونی حکومت، بر عهده مردم ایران خواهد بود.
عباس عراقچی، وزیر امور خارجه جمهوری اسلامی، در گفت‌وگویی با شبکه خبری فاکس‌نیوز گفت ایران علی‌رغم حملات آمریکا و اسرائیل، همچنان توان بازسازی زیرساخت‌ها و ازسرگیری غنی‌سازی را دارد؛ چون دانشمندان، فناوری و تجهیزات مورد نیاز همچنان در اختیار تهران است.
کانال ۱۲ تلویزیون اسرائیل در گزارشی تحلیلی نوشت که با وجود آتش‌بس، تهران و تل‌آویو خود را برای دور بعدی رویارویی آماده می‌کنند. به گفته این رسانه، نبرد ممکن است زودتر از انتظار آغاز شود.
حساب فارسی وزارت امور خارجه آمریکا با اعلام اینکه جمهوری اسلامی پس از پایان جنگ ۱۲ روزه با اسرائیل، وارد مرحله‌ای از «پارانوئید» و «تعقیب و گریز بی‌سابقه» علیه مخالفان و مظنونان به جاسوسی شده است، از شهروندان آمریکایی خواست از سفر به ایران خودداری کنند.
در پی تلاش‌های جمهوری اسلامی برای بازسازی نهادهای اطلاعاتی و امنیتی خود، خبرگزاری فارس وابسته به سپاه پاسداران، از نهایی‌شدن تغییرات ساختاری در شورای عالی امنیت ملی و ایجاد نهاد جدیدی به نام «شورای دفاع» خبر داد.